fa به کار گیری روش High Resolution Melting در شناسایی چند شکلی‌های نوکلئوتیدی ژرم لاین ژن STK11 در مبتلایان به انواع سرطان‌های دستگاه گوارش ژنتيك Genetic تحليلي/مقطعي/توصيفي Survey/Cross Sectional/Descriptive <span style="font-weight: bold">سابقه و هدف:</span> آنالیز HRM (High Resolution Melting) تکنیکی است که میزان کاهش فلورسنت را در طی فرایند شیب حرارتی ذوب DNA در اثر خروج رنگ اندازه‌گیری می‌نماید. ژن STK11 یکی از پروتئین‌های خانواده سرین- ترئونین کیناز سلولی را رمز می‌نماید که تنظیم کننده قطبیت سلولی بوده و هم‌چنین به عنوان پروتئین مهار کننده تومور عمل می‌نماید. موتاسیون‌های ژرم لاین در این ژن همراه با سندروم Peutz-Jeghers واستعداد ابتلاء به انواع نئوپلازی‌ها می‌باشند.<br><span style="font-weight: bold">روش بررسی: </span>در این مطالعه تجربی، DNA ژنومی از 56 بیمار مبتلا به انواع سرطان‌های دستگاه گوارش استخراج گردید. سپس ما تغیرات نوکلئوتیدی را در تمام طول ژن با استفاده از تکنیک Real-time PCR و High(HRM) resolution melting بررسی نمودیم. <br><span style="font-weight: bold">یافته‌ها:</span> غربالگری نوکلئوتیدی با تکنیک HRM دو نوع SNP در اینترون‌های 6 و 7 در 10 بیمار را نشان داد. 4 بیماردارای تغییر نوکلئوتیدی C/T [cluster id/dsSNP/rs9282860] در اینترون 6 به صورت هموزیگوس و شش بیمار دارای تغییر نوکلئوتیدی C/G [cluster id/dsSNP/rs2075607] در اینترون 7 بصورت هتروزیگوس بودند. همچنین مقایسه نتایج HRM با نتایج تعیین توالی یک مطابقت 100 درصدی را نشان داد. <br><span style="font-weight: bold">نتیجه‌گیری:</span> هر چند در این مطالعه موتاسیونی در بخش اگزون ژن مشاهده نگردید، به هر حال نتایج این مطالعه نشان می‌دهد غربالگری اولیه ژن STK11هم برای شناسایی تغییرات نوکلئوتیدی ناشناخته ژرم لاین و هم سوماتیک در مبتلایان به نئوپلازی به منظور تشخیص علت بیماری از طریق روش HRM به سهولت و با هزینه نسبتا اندک قابل اجراء می‌باشد. <span style="font-weight: bold">Background</span>: High Resolution Melting (HRM) is a method that analyzes genetic variations such as Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in PCR amplicons. The STK11 gene encodes a member of the serine/threonine kinase and regulates cell polarity and function as a tumor suppressor gene. The germ-line mutations in this gene are associated with Peutz-Jeghers syndrome. The patients with this syndrome are prone to some types of neoplasm. <br><span style="font-weight: bold">Materials and methods</span>: In this experimental study, genomic DNA was extracted from the whole blood samples of 56 patients with various gastrointestinal cancers. The nucleotide changes in the entire STK11 gene were analyzed by Real-time PCR and H RM technique. <br><span style="font-weight: bold">Results</span>: The nucleotide screening by HRM technique showed two types of SNPs in introns 6 and 7 of STK11 gene in 10 patients. Four patients had C / T substitution [cluster id/dsSNP/rs9282860] with homozygous genotype in intron 6, and six patients showed a C/G substitution [cluster id/dsSNP/rs2075607] with heterozygous genotype in intron 7. The direct sequencing of the fragments confirmed that the results obtained by HRM were 100% reliable. <br><span style="font-weight: bold">Conclusion</span>: In this study we found no SNP in exons of STK11 gene. However, two SNPs were found in the introns of this gene. Our results show that the primary screening of the STK11gene by the HRM technique is easily applicable to detect the unknown germ line and somatic mutations in patients with neoplasia at a relatively low cost. ژن STK11 ، موتاسیون‌های ژرم لاین، High resolution melting STK11gene, Germ line mutations, High resolution melting 233 237 http://tmuj.iautmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-155-19&slc_lang=fa&sid=1 Seyed Jamal Hosseini سیدجمال حسینی 10031947532846003247 10031947532846003247 No Reseacher Member of Society of Biology, Islamic Azad University, Tonekabon Branch, Tonekabon, Iran پژوهشگرعضو انجمن زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی تنکابن Ali Nazemi علی ناظمی a_nazemi@tonekaboniau.ac.ir 10031947532846003248 10031947532846003248 Yes Assistant Professor, Department of Biology, Islamic Azad University, Tonekabon Branch, Tonekabon, Iran گروه بیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن Mehrdad Hashemi مهرداد هاشمی 10031947532846003249 10031947532846003249 No Associate Professor, Department of Molecular Genetics, Islamic Azad University, Tehran Medical Branch, Tehran, Iran گروه ژنتیک مولکولی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران پزشکی MirSaed Miri Nargesi میرساعد میری نرگسی 10031947532846003250 10031947532846003250 No PhD Student of Molecular Genetics, Islamic Azad University, Tonekabon Branch, Tonekabon, Iran دانشجوی دکتری ژنتیک مولکولی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن Shahr Ashoob Sharifi شهرآشوب شریفی 10031947532846003251 10031947532846003251 No BS of Genetics, Islamic Azad University, Tonekabon Branch, Tonekabon, Iran کارشناس ژنتیک، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن