|
به کار گیری روش High Resolution Melting در شناسایی چند شکلی‌های نوکلئوتیدی ژرم لاین ژن STK11 در مبتلایان به انواع سرطان‌های دستگاه گوارش
|
سیدجمال حسینی1   ، علی ناظمی 2، مهرداد هاشمی3 ، میرساعد میری نرگسی4 ، شهرآشوب شریفی5 |
1- پژوهشگرعضو انجمن زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی تنکابن
2- گروه بیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن ، a_nazemi@tonekaboniau.ac.ir
3- گروه ژنتیک مولکولی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران پزشکی
4- دانشجوی دکتری ژنتیک مولکولی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن
5- کارشناس ژنتیک، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن |
|
|
چکیده: (22627 مشاهده) |
سابقه و هدف: آنالیز HRM (High Resolution Melting) تکنیکی است که میزان کاهش فلورسنت را در طی فرایند شیب حرارتی ذوب DNA در اثر خروج رنگ اندازه‌گیری می‌نماید. ژن STK11 یکی از پروتئین‌های خانواده سرین- ترئونین کیناز سلولی را رمز می‌نماید که تنظیم کننده قطبیت سلولی بوده و همچنین به عنوان پروتئین مهار کننده تومور عمل می‌نماید. موتاسیون‌های ژرم لاین در این ژن همراه با سندروم Peutz-Jeghers واستعداد ابتلاء به انواع نئوپلازی‌ها می‌باشند.
روش بررسی: در این مطالعه تجربی، DNA ژنومی از 56 بیمار مبتلا به انواع سرطان‌های دستگاه گوارش استخراج گردید. سپس ما تغیرات نوکلئوتیدی را در تمام طول ژن با استفاده از تکنیک Real-time PCR و High(HRM) resolution melting بررسی نمودیم.
یافته‌ها: غربالگری نوکلئوتیدی با تکنیک HRM دو نوع SNP در اینترون‌های 6 و 7 در 10 بیمار را نشان داد. 4 بیماردارای تغییر نوکلئوتیدی C/T [cluster id/dsSNP/rs9282860] در اینترون 6 به صورت هموزیگوس و شش بیمار دارای تغییر نوکلئوتیدی C/G [cluster id/dsSNP/rs2075607] در اینترون 7 بصورت هتروزیگوس بودند. همچنین مقایسه نتایج HRM با نتایج تعیین توالی یک مطابقت 100 درصدی را نشان داد.
نتیجه‌گیری: هر چند در این مطالعه موتاسیونی در بخش اگزون ژن مشاهده نگردید، به هر حال نتایج این مطالعه نشان می‌دهد غربالگری اولیه ژن STK11هم برای شناسایی تغییرات نوکلئوتیدی ناشناخته ژرم لاین و هم سوماتیک در مبتلایان به نئوپلازی به منظور تشخیص علت بیماری از طریق روش HRM به سهولت و با هزینه نسبتا اندک قابل اجراء می‌باشد. |
|
| واژه‌های کلیدی: ژن STK11، موتاسیون‌های ژرم لاین، High resolution melting |
|
|
متن کامل [PDF 423 kb]
(6104 دریافت)
|
نيمه آزمايشي : تحليلي/مقطعي/توصيفي |
موضوع مقاله:
ژنتيك
دریافت: 1390/11/25 | انتشار: 1390/11/26
|
|
|
|
|
|
|
| ارسال پیام به نویسنده مسئول |
|
|
|
| ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|
|
