Medical Sciences Journal of Islamic Azad University

fa بررسی فراوانی ژنوتایپ سویه‌های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس جدا شده از بیماران مسلول مراجعه کننده به انستیتو پاستور ایران Evaluation of the prevalence of Mycobacterium tuberculosis strains isolated from tuberculosis patients referred to Pasteur Institute of Iran ميكروبيولوژي Microbiology موردي- شاهدي case-control سابقه و هدف: بیماری سل به عنوان تهدیدی برای سلامت بهداشت جهانی مطرح است. بررسی اپیدمیولوژی بیماری سل می‌تواند در شناسایی منبع عفونت، سویههای غالب در حال گردش و دستیابی به مسیرهای انتقال در دنیا، نقش موثری داشته باشد. هدف از این مطالعه، تعیین ژنوتایپ سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بیماران مراجعه کننده به انستیتو پاستور ایران در سالهای 1397-1396 بود. روش بررسی: در این مطالعه، 50 سویه تایید شده از نظر عفونت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مورد بررسی قرار گرفتند. سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بعد از شناسایی و تعیین الگوی حساسیت دارویی با روش MIRU-VNTR (Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit Variable Number Tandem Repeat)، تعیین ژنوتایپ شدند.  یافته ها: ژنوتایپهای شناسایی شده CAS/Delhi (42%)، Haarlem (%24)، NEW-1 (%10)، LAM (%8)، Beijing  (%8)،Cameroon  (%4)، EAI (%2) و S (%2) تعیین شدند و سه کلونال کمپلکس و 44 سویه singleton شناسایی شدند. در سویه های مقاوم،ژنوتایپ Beijing، ژنوتایپ غالب بود. هم چنین لوکوس های QUB26 و QUB4156 دارای بالاترین قدرت افتراق و تنوع آللی بودند. نتیجه گیری: ژنوتایپ CAS/Delhi وBeijing  به ترتیب به عنوان ژنوتایپهای غالب در سویههای حساس به دارو و MDR معرفی شدند. Background: Tuberculosis is a threat to public health. The epidemiology of tuberculosis can be effective in identifying the source of infection, the dominant circulating strains and achieving transmission pathways in the world. The aim of this study was to determine the genotype of Mycobacterium tuberculosis (M. tb) strains in patients referred to Pasteur Institute of Iran between 2018 and 2019. Materials and methods: In this study, 50 confirmed M. tb strains were evaluated. After M. tb strains identification and determining the drug susceptibility test, all strains were genotyped by MIRU-VNTR (Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit Variable Number Tandem Repeat) method. Results: The most frequent genotype in all strains was CAS/Delhi (42%), followed by Haarlem (24%), NEW-1 (10%), LAM (8%), Beijing (8%), Cameroon (4%), EAI (% 2) and S (2%). Three clonal complexes and 44 singleton isolates were identified. Beijing genotype was the common genotype in MDR-TB strains. Also, QUB26 and QUB4156 loci had shown the highest of discriminative and allelic diversity. Conclusion: CAS/Delhi and Beijing genotypes were introduced as the dominant genotypes in drug sensitive and MDR strains, respectively. مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, MIRU-VNTR, ژنوتایپ. Mycobacterium tuberculosis, MIRU-VNTR, Genotype. 328 337 http://tmuj.iautmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-478-1&slc_lang=fa&sid=1 Nayereh Ebrahimzadeh نیره ابراهیم زاده nebrahimzadeh50@gmail.com 10031947532846009660 10031947532846009660 No Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran گروه زیست شناسی، دانشگاه آزاد واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران Shiva Irani شیوا ایرانی s.irani@srbiau.ac.ir 10031947532846009661 10031947532846009661 No Department of Biochemistry, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran گروه بیوشیمی، انستیتوپاستور ایران، تهران، ایران Shohreh Khatami شهره خاتمی sh-khatami@pasteur.ac.ir 10031947532846009662 10031947532846009662 No Department of Mycobacteriology and Pulmonary Research, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran بخش سل و تحقیقات ریوی، انستیتوپاستور ایران، تهران، ایران Seyed Davar Siadat سید داور سیادت d.siadat@gmail.com 10031947532846009663 10031947532846009663 Yes Department of Mycobacteriology and Pulmonary Research, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran -Microbiology Research Center (MRC), Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran بخش سل و تحقیقات ریوی، انستیتوپاستور ایران، تهران، ایران - مرکز تحقیقات میکروب شناسی، انستیتوپاستور ایران، تهران، ایران