[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای داوران::
ثبت نام ::
اشتراک::
اطلاعات نمایه::
برای نویسندگان::
لینکهای مفید::
فرآیند چاپ::
پست الکترونیک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
:: دوره 33، شماره 1 - ( بهار 1402 ) ::
جلد 33 شماره 1 صفحات 58-50 برگشت به فهرست نسخه ها
ارزیابی محاسباتی، طراحی و بیان آنتی‌بادی هیبرید به فرم تک زنجیره(scFv) Single Chain Fragment Antibody برای شناسایی پروتئین سطحی Factor H binding Protein (fHbp) باکتری نایسریا مننژیتیدیس
مرجان خاجوی1 ، فاطمه یاریان 2، شهرزاد اهنگرزاده3 ، مژگان بنده پور4 ، محسن محمدپور5 ، اکرم جلالی6
1- دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران
2- استادیارگروه بیوتکنولوژی پزشکی، دانشکده فناوریهای نوین پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی فسا، فسا، ایران ، f.yarian@fums.ac.ir
3- استادیار مرکز تحقیقات بیماریهای عفونی و گرمسیری، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران
4- استاد، مرکز تحقیقات بیولوژی سلولی و مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
5- گروه مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد فسا، فسا، ایران
6- استادیار، مرکز تحقیقات پزشکی و مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران
چکیده:   (542 مشاهده)
سابقه و هدف: فاکتور بیماری­زای پروتئین متصل شونده به فاکتور H (fHbp) نقش حیاتی در بقای پاتوژن در میزبان دارد. آنتی­بادی­های تک زنجیره به فرم  scFv کاربردهای درمانی و تشخیصی دارند. هدف از انجام این مطالعه، استفاده از روش­های محاسباتی، طراحی، بیان و بررسی قدرت اتصال آنتی بادی تک زنجیره هیبریدی برای شناسایی باکتری نایسریامننژیتیدیس، عامل بیماری مننگوکوک، بود.
روش بررسی: در این تحقیق با انجام یک سری ارزیابی­های محاسباتی (مدلسازی آنتی ژن، آنتی بادی و داکینگ آنتی ژن-آنتی بادی)، آنتی بادی هیبریدی با قدرت اتصال  بالا به پروتئین fHbp طراحی شد. سازه ژنی آن در وکتور بیانی pET28a(+) سنتز شد و پس از بیان در باکتری BL21 و خالص سازی با استفاده از رزین Ni-NTA، میل اتصال آن با پروتئین fHbp با استفاده از روش الایزا بررسی شد. 
یافته ها: فرم هیبریدی (VH1-VL2) با استفاده از ارزیابی­های محاسباتی انتخاب شد. بیان سازه طراحی شده با استفاده از SDS-PAGE و وسترن بلاتینگ تائید شد. پس از خالص سازی آنتی بادی و آنتی ژن fHbp، در بررسی­های الایزا، میل اتصال این فرم هیبریدی  scFv M10-9 ×6/7 محاسبه شد.
نتیجه گیری: میل اتصال مناسب فرم هیبریدی آنتی بادی نشان می­دهد که با استفاده از روش­های مهندسی آنتی­بادی و روش­های محاسباتی، می­توان به اشکال دیگری  از آنتی بادی­های تک زنجیره دست یافت که برای اهداف درمانی و تشخیصی کاربرد دارند.
واژگان کلیدی: آنتی بادی تک زنجیره هیبرید، باکتری نایسریا مننژیتیدیس، پروتئین متصل شونده به فاکتور H، کلونینگ و بیان پروتئین.

 
واژه‌های کلیدی: آنتی بادی تک زنجیره هیبرید (Hybrid scFv)، باکتری Neisseria Meningitides، پروتئین متصل شونده به فاکتور H (factor H binding protein)، کلونینگ و بیان پروتئین
متن کامل [PDF 466 kb]   (209 دریافت)    
نيمه آزمايشي : بنيادي | موضوع مقاله: بيوتكنولوژي
دریافت: 1401/4/18 | پذیرش: 1401/7/24 | انتشار: 1402/1/10
فهرست منابع
1. Read RC. Neisseria meningitidis and meningococcal disease: recent discoveries and innovations. Curr Opin Infect Dis 2019;32:601-8. 2. Booy R, Gentile A, Nissen M, Whelan J, Abitbol V. Recent changes in the epidemiology of Neisseria meningitidis serogroup W across the world, current vaccination policy choices and possible future strategies. Hum Vaccin Immunother 2019;15:470-80. https://doi.org/10.1080/21645515.2018.1532248 3. Gasparini R, Amicizia D, Lai PL, Panatto D. Neisseria meningitidis, pathogenetic mechanisms to overcome the human immune defences. J Prev Med Hyg 2012;53:50-5. 4. Gasparini R, Amicizia D, Lai PL, Panatto D. Meningococcal B vaccination strategies and their practical application in Italy. J Prev Med Hyg 2015;56:E133-9. 5. McNeil LK, Zagursky RJ, Lin SL, Murphy E, Zlotnick GW, Hoiseth SK, et al. Role of factor H binding protein in Neisseria meningitidis virulence and its potential as a vaccine candidate to broadly protect against meningococcal disease. Microbiol Mol Biol Rev 2013;77:234-52. https://doi.org/10.1128/MMBR.00056-12 6. Goulet DR, Atkins WM. Considerations for the Design of Antibody-Based Therapeutics. J Pharm Sci 2020;109:74-103. https://doi.org/10.1016/j.xphs.2019.05.031 7. Chiu ML, Gilliland GL. Engineering antibody therapeutics. Curr Opin Struct Biol 2016;38:163-73. https://doi.org/10.1016/j.sbi.2016.07.012 8. Bemani P, Mohammadi M, Hakakian A. ScFv Improvement Approaches. Protein Pept Lett 2018;25:222-9. https://doi.org/10.2174/0929866525666171129225436 9. Yarian F, Kazemi B, Bandehpour M. Identification and characterization of a novel single-chain variable fragment (scFv) antibody against Neisseria meningitidis factor H-binding protein (fHbp). J Med Microbiol 2018;67:820-7. https://doi.org/10.1099/jmm.0.000744 10. Bandehpour M, Yarian F, Ahangarzadeh S. Bioinformatics evaluation of novel ribosome display-selected single chain variable fragment (scFv) structure with factor H binding protein through docking. Journal of Theoretical and Computational Chemistry 2019;16:1750021. https://doi.org/10.1142/S0219633617500213 11. Rafighdoust H, Ahangarzadeh S, Yarian F, Taheri RA, Lari A, Bandehpour M, et al. Bioinformatics prediction and experimental validation of VH antibody fragment interacting with Neisseria meningitidis factor H binding protein. Iran J Basic Med Sci 2020;23:1053-8. 12. Bandehpour M, Yarian F, Lari A, Farnia P. In silico evaluation of the interactions among two selected single chain variable fragments (scFvs) and ESAT-6 antigen of Mycobacterium tuberculosis. Journal of Theoretical and Computational Chemistry.2017;16:1750069. https://doi.org/10.1142/S0219633617500699 13. Dunbar J, Krawczyk K, Leem J, Marks C, Nowak J, Regep C, et al. SAbPred: a structure-based antibody prediction server. Nucleic Acids Res 2016;44:W474-78. https://doi.org/10.1093/nar/gkw361 14. Vajda S, Yueh C, Beglov D, Bohnuud T, Mottarella SE, Xia B, et al. New additions to the ClusPro server motivated by CAPRI. Proteins 2017;85:435-44. https://doi.org/10.1002/prot.25219 15. Desta IT, Porter KA, Xia B, Kozakov D, Vajda S. Performance and Its Limits in Rigid Body Protein-Protein Docking. Structure 2020;28:1071-81.e3. https://doi.org/10.1016/j.str.2020.06.006 16. Laskowski RA, Jabłońska J, Pravda L, Vařeková RS, Thornton JM. PDBsum: Structural summaries of PDB entries. Protein Sci 2018;27:129-34. https://doi.org/10.1002/pro.3289 17. Yarian F, Bandehpour M, Seyed N, Kazemi B. Cloning, expression and purification of the factor H binding protein and its interaction with factor H. Iran J Microbiol 2016;8:29-35. 18. Byrne B, Stack E, Gilmartin N, O'Kennedy R. Antibody-based sensors: principles, problems and potential for detection of pathogens and associated toxins. Sensors 2009;9:4407-45. https://doi.org/10.3390/s90604407 19. Rouphael NG, Stephens DS. Neisseria meningitidis: biology, microbiology, and epidemiology. Methods Mol Biol 2012;799:1-20. https://doi.org/10.1007/978-1-61779-346-2_1 20. Payandeh Z, Rajabibazl M, Mortazavi Y, Rahimpour A, Taromchi AH, Dastmalchi S. Affinity maturation and characterization of the ofatumumab monoclonal antibody. J Cell Biochem 2019;120:940-50. https://doi.org/10.1002/jcb.27457 [DOI:10.1097/QCO.0000000000000606]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Khajavi M, Yarian F, Ahangarzadeh S, Bandehpour M, Mohammadpour M, Jalali A. Computational analysis, design and expression of hybrid antibody in Single Chain Fragment Variable (scFv) form for identifying surface antigen factor H binding protein (fHbp) of Neisseria meningitidis. MEDICAL SCIENCES 2023; 33 (1) :50-58
URL: http://tmuj.iautmu.ac.ir/article-1-2015-fa.html

خاجوی مرجان، یاریان فاطمه، اهنگرزاده شهرزاد، بنده پور مژگان، محمدپور محسن، جلالی اکرم. ارزیابی محاسباتی، طراحی و بیان آنتی‌بادی هیبرید به فرم تک زنجیره(scFv) Single Chain Fragment Antibody برای شناسایی پروتئین سطحی Factor H binding Protein (fHbp) باکتری نایسریا مننژیتیدیس. فصلنامه علوم پزشکی دانشگاه آزاد اسلامی تهران. 1402; 33 (1) :50-58

URL: http://tmuj.iautmu.ac.ir/article-1-2015-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 33، شماره 1 - ( بهار 1402 ) برگشت به فهرست نسخه ها
فصلنامه علوم پزشکی دانشگاه آزاد اسلامی واحد پزشکی تهران Medical Science Journal of Islamic Azad Univesity - Tehran Medical Branch
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 37 queries by YEKTAWEB 4639