[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای داوران::
ثبت نام ::
اشتراک::
اطلاعات نمایه::
برای نویسندگان::
لینکهای مفید::
فرآیند چاپ::
پست الکترونیک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
:: دوره 33، شماره 4 - ( زمستان 1402 ) ::
جلد 33 شماره 4 صفحات 337-322 برگشت به فهرست نسخه ها
مقایسه پروفایل بیانی mRNA و ncRNA در بیماران مبتلا به سرطان روده با رویکرد سیستم بیولوژی بین سال‌های 1399 تا 1400
الین گنجی1 ، ملیحه انتظاری 2، سیدمحمد پورحسینی3
1- دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه ژنتیک، دانشکده علوم نوین، علوم پزشکی تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
2- مرکز تحقیقات علوم همگرایی پزشکی فرهیختگان، بیمارستان فرهیختگان، تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران ، drmentezari@gmail.com
3- گروه ژنتیک، دانشکده علوم و فناوری پیشرفته، علوم پزشکی تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
چکیده:   (304 مشاهده)
سابقه و هدف: به دسته­ای از سلول­ها که بیش از بافت نرمال تقسیم شوند، تومور سرطانی گفته می­شود. سرطان روده بزرگ در اکثر موارد، از پولیپ­های روده نشأت می­گیرد. پولیپ­های روده بزرگ، تکه­های گوشتی برآمده است که از پوشش داخلی روده بزرگ نشأت می­گیرند. توضیح روابط تنظیمی بین mRNA و lncRNA می­تواند به شناسایی الگوی تنظیم بیان ژن در سرطان کولورکتال بدخیم کمک کند. در این مطالعه یکپارچه سازی شبکه هم بیان ژنی وزندار در تومور بدخیم با آنالیز داده­های بیانی به دست آمده از نمونه­های افراد نرمال و مبتلا به سرطان بررسی شد.
روش بررسی: داده­های استفاده شده در این مقاله شامل توالی­های اگزوزومی lncRNA و mRNA بود که از exorbase  و پایگاه اطلاعاتی GEO  استخراج شد. شبکه هم بیان ژنی وزندار برای گروه­بندی ژن­ها و یافتن گروه­های ژنی که همبستگی قابل توجهی دارند، به کار برده شد.   
یافته­ها: در این مطالعه اهمیت پاتولوژیکی گروه­ها، با استفاده از میزان بیان گروه­ها دسته بندی شد. از بین گروه­ها، گروه سبز دارای بیشترین مقدار همبستگی و معنی­داری بود و به همین دلیل فرض بر این است که بیشترین تأثیر را در روند پیشرفت سرطان دارند.
نتیجه­گیری: با توجه به ژن­های کلیدی HSPA1B و PPP2R3B،HSPA1A در این مطالعه پیشنهاد می­شود با مقایسه افراد سالم و بیمار و شناسایی تفاوت پروفایل بیان ژنی به یک بیومارکر مناسب جهت شناسایی وتشخیص افرادمبتلا به سرطان کولورکتال دست یافت.
واژه‌های کلیدی: سرطان کولورکتال، بیان ژن، شبکه‌های تنظیم ژن، سیستم بیولوژی
متن کامل [PDF 1057 kb]   (168 دریافت)    
نيمه آزمايشي : بنيادي | موضوع مقاله: ژنتيك
دریافت: 1402/3/6 | پذیرش: 1402/5/28 | انتشار: 1402/9/10
فهرست منابع
1. Bray F, Ferlay J, Soerjomataram I, Siegel RL, Torre LA, Jemal A. Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin 2018;68394-424. [DOI:10.3322/caac.21492]
2. Arnold M, Sierra MS, Laversanne M, Soerjomataram I, Jemal A, Bray F. Global patterns and trends in colorectal cancer incidence and mortality. Gut 2017;66:683-91. [DOI:10.1136/gutjnl-2015-310912]
3. Fitzmaurice C, Allen C, Barber RM, Barregard L, Bhutta ZA, Brenner H, et al. Global, regional, and national cancer incidence, mortality, years of life lost, years lived with disability, and disability-adjusted life-years for 32 cancer groups, 1990 to 2015: a systematic analysis for the global burden of disease study. JAMA Oncol 2017;3:524-48. [DOI:10.1001/jamaoncol.2016.5688]
4. Dekker E, Tanis PJ, Vleugels JL, Kasi PM, Wallace M. Pure-AMC. Lancet 2019;394:1467-80. [DOI:10.1016/S0140-6736(19)32319-0]
5. Keum N, Giovannucci E. Global burden of colorectal cancer: emerging trends, risk factors and prevention strategies. Nat Rev Gastroenterol Hepatol 2019;16:713-32. [DOI:10.1038/s41575-019-0189-8]
6. Siegel RL, Miller KD, Fuchs HE, Jemal A. Cancer statistics, 2021. Ca Cancer J Clin 2021;71:7-33. [DOI:10.3322/caac.21654]
7. Szczuka I, Wierzbicki J, Serek P, Szczęśniak-Sięga BM, Krzystek-Korpacka M. Heat shock proteins HSPA1 and HSP90AA1 are upregulated in colorectal polyps and can be targeted in cancer cells by anti-inflammatory oxicams with arylpiperazine pharmacophore and benzoyl moiety substitutions at thiazine ring. Biomolecules 2021;11:1588. [DOI:10.3390/biom11111588]
8. Chung C. Unique glioma requiring unique management. Int J Radiat Oncol Biol Phys 2020;108:520-21. [DOI:10.1016/j.ijrobp.2019.09.021]
9. Yong L, YuFeng Z, Guang B. Association between PPP2CA expression and colorectal cancer prognosis tumor marker prognostic study. Int J Surg 2018;59:80-9. [DOI:10.1016/j.ijsu.2018.09.020]
10. Wang H, Liu J, Li J, Zang D, Wang X, Chen Y, et al. Identification of gene modules and hub genes in colon adenocarcinoma associated with pathological stage based on WGCNA analysis. Cancer Genet 2020;242:1-7. [DOI:10.1016/j.cancergen.2020.01.052]
11. Acharya UR, Fujita H, Oh SL, Hagiwara Y, Tan JH, Adam M. Application of deep convolutional neural network for automated detection of myocardial infarction using ECG signals. Information Sciences 2017;415:190-8. [DOI:10.1016/j.ins.2017.06.027]
12. Zhao H, Chen S, Fu Q. Exosomes from CD133+ cells carrying circ‐ABCC1 mediate cell stemness and metastasis in colorectal cancer. J Cell Biochem 2020;121:3286-97. [DOI:10.1002/jcb.29600]
13. Jin Y, Li R, Zhang Z, Ren J, Song X, Zhang G. ZBED1/DREF: A transcription factor that regulates cell proliferation. Oncol Lett 2020;20:137. [DOI:10.3892/ol.2020.11997]
14. Qin Y, Sun W, Wang Z, Dong W, He L, Zhang T, et al. RBM47/SNHG5/FOXO3 axis activates autophagy and inhibits cell proliferation in papillary thyroid carcinoma. Cell Death Dis 2022;13:270. [DOI:10.1038/s41419-022-04728-6]
15. Koveitypour Z, Panahi F, Vakilian M, Peymani M, Seyed Forootan F, Nasr Esfahani MH,et al. Signaling pathways involved in colorectal cancer progression. Cell Biosci 2019;9:1-4. [DOI:10.1186/s13578-019-0361-4]
16. Kumar A, Deep A, Gupta RK, Atam V, Mohindra S. Brain Microstructural Correlates of Cognitive Dysfunction in Clinically and Biochemically Normal Hepatitis C Virus Infection. J Clin Exp Hepatol 2017;7:198-204. [DOI:10.1016/j.jceh.2017.03.011]
17. Katz DH, Deo RC, Aguilar FG, Selvaraj S, Martinez EE, Beussink-Nelson L, et al. Phenomapping for the identification of hypertensive patients with the myocardial substrate for heart failure with preserved ejection fraction. J Cardiovasc Translat Res 2017;10:275-84. [DOI:10.1007/s12265-017-9739-z]
18. Polubothu S, Zecchin D, Al-Olabi L, Lionarons DA, Harland M, Horswell S, et al. Inherited duplications of PPP2R3B predispose to nevi and melanoma via a C21orf91-driven proliferative phenotype. Genet Med 2021;23:1636-47. [DOI:10.1038/s41436-021-01204-y]
19. Jiang S, Wang Y, Xiong Y, Feng Y, Tang J, Song R. Highexpression of ZBED1 affects proliferation and apoptosis in gastric cancer. Int J Clin Exp Pathol 2018;11:4019.
20. Wang X, Wang Y, Fang Z, Wang H, Zhang J, Zhang L,et al. Targeting HSPA1A in ARID2-deficient lung adenocarcinoma. Nat Sci Rev 2021;8:nwab014. [DOI:10.1093/nsr/nwab014]
21. Guan Y, Zhu X, Liang J, Wei M, Huang S, Pan X. Upregulation of HSPA1A/HSPA1B/HSPA7 and downregulation of HSPA9 were related to poor survival in colon cancer. Front Oncol 2021;11:749673. [DOI:10.3389/fonc.2021.749673]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Ganji E, Entezari M, Poorhosseini S M. Comparison of mRNA and ncRNA expression profiles in colon cancer patients with system biology approach between 2020 and 2021. MEDICAL SCIENCES 2023; 33 (4) :322-337
URL: http://tmuj.iautmu.ac.ir/article-1-2106-fa.html

گنجی الین، انتظاری ملیحه، پورحسینی سیدمحمد. مقایسه پروفایل بیانی mRNA و ncRNA در بیماران مبتلا به سرطان روده با رویکرد سیستم بیولوژی بین سال‌های 1399 تا 1400. فصلنامه علوم پزشکی دانشگاه آزاد اسلامی تهران. 1402; 33 (4) :322-337

URL: http://tmuj.iautmu.ac.ir/article-1-2106-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 33، شماره 4 - ( زمستان 1402 ) برگشت به فهرست نسخه ها
فصلنامه علوم پزشکی دانشگاه آزاد اسلامی واحد پزشکی تهران Medical Science Journal of Islamic Azad Univesity - Tehran Medical Branch
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 37 queries by YEKTAWEB 4645