[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای داوران::
ثبت نام ::
اشتراک::
اطلاعات نمایه::
برای نویسندگان::
لینکهای مفید::
فرآیند چاپ::
پست الکترونیک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
:: دوره 34، شماره 2 - ( تابستان 1403 ) ::
جلد 34 شماره 2 صفحات 128-121 برگشت به فهرست نسخه ها
مقایسه دو روش استخراج وزیکول‌های خارج سلولی از Clostridium perfringens
سهیلا استادمحمدی1 ، سید علی نجومی 2، ابوالفضل فاتح3 ، سید داور سیادت4 ، فتاح ستوده نژاد نعمت اللهی5
1- دانشجوی دکتری میکروبیولوژی، گروه زیست شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
2- استادیار میکروبیولوژی، گروه مایکوباکتریولوژی و تحقیقات ریوی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران ، ali.nojoumi@gmail.com
3- دانشیار ویروس شناسی پزشکی، گروه مایکوباکتریولوژی و تحقیقات ریوی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران
4- استاد باکتری شناسی پزشکی، گروه مایکوباکتریولوژی و تحقیقات ریوی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران
5- استادیار ایمنی سلولی و مولکولی، گروه زیست شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
چکیده:   (110 مشاهده)
سابقه و هدف: وزیکول‌های خارج سلولی (EVs)، وزیکول‌هایی با اندازه نانو تا میکرون هستند که می‌توانند محموله‌های زیستی را حمل کنند. همه انواع سلول‌ها می‌توانند EVها را ترشح کنند که مشارکت آنها در مکانیسم‌های حیاتی مختلف سلول مشاهده شده است. روش‌های مختلفی جهت جداسازی EVها وجود دارد که دارای مزایا و معایبی هستند. هدف از مطالعه حاضر بررسی روش غیراولتراسانتریفیوژ و اولتراسانتریفیوژ در جداسازی EVها بود.
روش بررسی: در این مطالعه تجربی ازATCC13124  perfringens Clostridium استفاده شد. بعد از کشت، استخراج EVها با دو روش غیراولتراسانتریفیوژ و اولتراسانتریفیوژ انجام شد. برای بررسی خصوصیات شیمیایی از تعیین غلظت پروتئینی EV با استفاده از دستگاه NanoDrop استفاده شد و الگوی پروتئینی EV با استفاده از تکنیک SDS-PAGE انجام شد. میکروسکوپ الکترونی عبوری(TEM) جهت بررسی خصوصیات فیزیکی EVها استفاده شد. 
یافته­ها: نتایج ما نشان داد که EVs جدا شده با روش اولتراسانتریفیوژ میزان پروتئین بالاتری در مقایسه با روش غیراولتراسانتریفیوژ ( به ترتیب17/3 و 46/1 میکروگرم بر میلی لیتر) داشتند. روش اولتراسانتریفیوژ نسبت به روش غیراولتراسانتریفیوژ،  EVs بیشتر و بزرگتری را جدا کرده بود. همچنین، الگوی های پروتئینی EVs با روش SDS-PAGE در هر دو روش مشابه بودند.
نتیجه­گیری: نتیجه مطالعه حاضر نشان داد که جداسازی EVهای حاصل از perfringens Clostridium با روش اولتراسانتریفیوژ می‌تواند روش بهینه‌تر و مقرون به صرفه‌تری نسبت به روش غیراولتراسانتریفیوژ باشد.
 
واژه‌های کلیدی: Clostridium perfringens، وزیکول‌های خارج سلولی، اولتراسانتریفیوژ، روش های استخراج EV.
متن کامل [PDF 800 kb]   (87 دریافت)    
نيمه آزمايشي : تجربي | موضوع مقاله: ميكروبيولوژي
دریافت: 1402/5/28 | پذیرش: 1402/7/4 | انتشار: 1403/4/10
فهرست منابع
1. Bishop D, Work E. An extracellular glycolipid produced by Escherichia coli grown under lysine-limiting conditions. Bioch J 1965;96:567. [DOI:10.1042/bj0960567]
2. Bose S, Aggarwal S, Singh DV, Acharya N. Extracellular vesicles: An emerging platform in gram-positive bacteria. Microb Cell 2020;7:312. [DOI:10.15698/mic2020.12.737]
3. Takeo K, Uesaka I, Uehira K, Nishiura M. Fine structure of Cryptococcus neoformans grown in vitro as observed by freeze-etching. J Bacteriol 1973;113:1442-8. [DOI:10.1128/jb.113.3.1442-1448.1973]
4. Dorward DW, Garon CF. DNA is packaged within membrane-derived vesicles of Gram-negative but not Gram-positive bacteria. Appl Environ Microbiol 1990;56:1960-2. [DOI:10.1128/aem.56.6.1960-1962.1990]
5. Shockman GD, Barren JF. Structure, function, and assembly of cell walls of gram-positive bacteria. Ann Rev Microbiol 1983;37:501-27. [DOI:10.1146/annurev.mi.37.100183.002441]
6. Brennan PJ. Structure, function, and biogenesis of the cell wall of Mycobacterium tuberculosis. Tuberculosis 2003;83:91-7. [DOI:10.1016/S1472-9792(02)00089-6]
7. Free SJ. Fungal cell wall organization and biosynthesis. Adv Genet 2013;81:33-82. [DOI:10.1016/B978-0-12-407677-8.00002-6]
8. Rodrigues ML, Nimrichter L, Oliveira DL, Frases S, Miranda K, Zaragoza O, et al. Vesicular polysaccharide export in Cryptococcus neoformans is a eukaryotic solution to the problem of fungal trans-cell wall transport. Eukaryot Cell 2007;6:48-59. [DOI:10.1128/EC.00318-06]
9. Marsollier L, Brodin P, Jackson M, Korduláková J, Tafelmeyer P, Carbonnelle E, et al. Impact of Mycobacterium ulcerans biofilm on transmissibility to ecological niches and Buruli ulcer pathogenesis. PLoS Pathog 2007;3:e62. [DOI:10.1371/journal.ppat.0030062]
10. Van der Pol E, Coumans F, Varga Z, Krumrey M, Nieuwland R. Innovation in detection of microparticles and exosomes. J Thromb Haemost 2013;11:36-45. [DOI:10.1111/jth.12254]
11. Biedka S, Eutsey R, Hiller L, Minden JS. Membrane Protein Comparison Between Cell Membranes and ExtracellularVvesicle Membranes of S. pneumoniae Provide Insights into Extracellular Vesicle Formation and Shedding. FASEB J 2022;36. [DOI:10.1096/fasebj.2022.36.S1.R6072]
12. Turunen J, Tejesvi MV, Suokas M, Virtanen N, Paalanne N, Kaisanlahti A, et al. Bacterial extracellular vesicles in the microbiome of first-pass meconium in newborn infants. Pediatr Res 2023;93:887-96. [DOI:10.1038/s41390-022-02242-1]
13. Schaack B, Hindré T, Quansah N, Hannani D, Mercier C, Laurin D. Microbiota-Derived extracellular vesicles detected in human blood from healthy donors. Int J Mol Sci 2022;23:13787. [DOI:10.3390/ijms232213787]
14. Jiang Y, Kong Q, Roland KL, Curtiss III R. Membrane vesicles of Clostridium perfringens type A strains induce innate and adaptive immunity. Int J Med Microbiol 2014;304:431-43. [DOI:10.1016/j.ijmm.2014.02.006]
15. Liao S, Klein MI, Heim KP, Fan Y, Bitoun JP, Ahn S-J, et al. Streptococcus mutans extracellular DNA is upregulated during growth in biofilms, actively released via membrane vesicles, and influenced by components of the protein secretion machinery. J Bacteriol 2014;196:2355-66. [DOI:10.1128/JB.01493-14]
16. Ibrahim A, Marbán E. Exosomes: fundamental biology and roles in cardiovascular physiology. Ann Rev Physiol 2016;78:67-83. [DOI:10.1146/annurev-physiol-021115-104929]
17. Fleury A, Martinez MC, Le Lay S. Extracellular vesicles as therapeutic tools in cardiovascular diseases. Front Immunol 2014;5:370. [DOI:10.3389/fimmu.2014.00370]
18. Balhuizen MD, Veldhuizen EJ, Haagsman HP. Outer membrane vesicle induction and isolation for vaccine development. Front Microbiol 2021;12:629090. [DOI:10.3389/fmicb.2021.629090]
19. Martinón-Torres F, Safadi MAP, Martinez AC, Marquez PI, Torres JCT, Weckx LY, et al. Reduced schedules of 4CMenB vaccine in infants and catch-up series in children: Immunogenicity and safety results from a randomised open-label phase 3b trial. Vaccine 2017;35:3548-57. [DOI:10.1016/j.vaccine.2017.05.023]
20. Lee T-Y, Kim C-U, Bae E-H, Seo S-H, Jeong DG, Yoon S-W, et al. Outer membrane vesicles harboring modified lipid A moiety augment the efficacy of an influenza vaccine exhibiting reduced endotoxicity in a mouse model. Vaccine 2017;35:586-95. [DOI:10.1016/j.vaccine.2016.12.025]
21. Momen-Heravi F, Balaj L, Alian S, Trachtenberg AJ, Hochberg FH, Skog J, et al. Impact of biofluid viscosity on size and sedimentation efficiency of the isolated microvesicles. Front Physiol 2012;3:162. [DOI:10.3389/fphys.2012.00162]
22. Cantin R, Diou J, Bélanger D, Tremblay AM, Gilbert C. Discrimination between exosomes and HIV-1: purification of both vesicles from cell-free supernatants. J Immunol Methods 2008;338:21-30. [DOI:10.1016/j.jim.2008.07.007]
23. Cheruvanky A, Zhou H, Pisitkun T, Kopp JB, Knepper MA, Yuen PS, et al. Rapid isolation of urinary exosomal biomarkers using a nanomembrane ultrafiltration concentrator. Am J Physiol Renal Physiol 2007;292:F1657-F61. [DOI:10.1152/ajprenal.00434.2006]
24. Obana N, Nakao R, Nagayama K, Nakamura K, Senpuku H, Nomura N. Immunoactive clostridial membrane vesicle production is regulated by a sporulation factor. Infect Immun 2017;85:e00096-17. [DOI:10.1128/IAI.00096-17]
25. Sharifat Salmani A, Siadat SD, Norouzian D, Izadi Mobarakeh J, Kheirandish M, Zangeneh M, et al. Outer membrane vesicle of Neisseria meningitidis serogroup B as an adjuvant to induce specific antibody response against the lipopolysaccharide of Brucella abortus S99. Ann Microb 2009;59:145-9. [DOI:10.1007/BF03175612]
26. Badi SA, Khatami S, Irani S, Siadat SD. Induction effects of bacteroides fragilis derived outer membrane vesicles on toll like receptor 2, toll like receptor 4 genes expression and cytokines concentration in human intestinal epithelial cells. Cell J 2019;21:57.
27. Ashrafian F, Shahriary A, Behrouzi A, Moradi HR, Keshavarz Azizi Raftar S, Lari A, et al. Akkermansia muciniphila-derived extracellular vesicles as a mucosal delivery vector for amelioration of obesity in mice. Front Microbiol 2019;10:2155. [DOI:10.3389/fmicb.2019.02155]
28. Rabiei N, Ahmadi Badi S, Ettehad Marvasti F, Nejad Sattari T, Vaziri F, Siadat S. Comparison of two isolation methods for extracellular vesicles from Faecalibacterium prausnitzii A2-165. Vaccine Research 2018;5:27-31. [DOI:10.29252/vacres.5.1.27]
29. Elhenawy W, Debelyy MO, Feldman MF. Preferential packing of acidic glycosidases and proteases into Bacteroides outer membrane vesicles. MBio 2014;5: e00909-14. [DOI:10.1128/mBio.00909-14]
30. Lee EY, Bang JY, Park GW, Choi DS, Kang JS, Kim HJ, et al. Global proteomic profiling of native outer membrane vesicles derived from Escherichia coli. Proteomics 2007;7:3143-53. [DOI:10.1002/pmic.200700196]
31. Rivera J, Cordero RJ, Nakouzi AS, Frases S, Nicola A, Casadevall A. Bacillus anthracis produces membrane-derived vesicles containing biologically active toxins. Proc Natl Acad Sci U S A 2010;107:19002-7. [DOI:10.1073/pnas.1008843107]
32. Szatanek R, Baran J, Siedlar M, Baj-Krzyworzeka M. Isolation of extracellular vesicles: Determining the correct approach. Int J Mol Med 2015;36:11-7. [DOI:10.3892/ijmm.2015.2194]
33. Konoshenko MY, Lekchnov EA, Vlassov AV, Laktionov PP. Isolation of extracellular vesicles: general methodologies and latest trends. BioMed Res Int 2018;2018. [DOI:10.1155/2018/8545347]
34. Maas SL, De Vrij J, Van Der Vlist EJ, Geragousian B, Van Bloois L, Mastrobattista E, et al. Possibilities and limitations of current technologies for quantification of biological extracellular vesicles and synthetic mimics. J Control Release 2015;200:87-96. [DOI:10.1016/j.jconrel.2014.12.041]
35. Kang C-s, Ban M, Choi E-J, Moon H-G, Jeon J-S, Kim D-K, et al. Extracellular vesicles derived from gut microbiota, especially Akkermansia muciniphila, protect the progression of dextran sulfate sodium-induced colitis. PloS One 2013;8:e76520. [DOI:10.1371/journal.pone.0076520]
36. Li M, Lee K, Hsu M, Nau G, Mylonakis E, Ramratnam B. Lactobacillus-derived extracellular vesicles enhance host immune responses against vancomycin-resistant enterococci. BMC Microbiol 2017;17:1-8. [DOI:10.1186/s12866-017-0977-7]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Ostadmohammadi S, Nojoumi S A, Fateh A, Siadat S D, Sotoodehnejadnematalahi F. Comparison of two extraction methods of extracellular vesicles from Clostridium perfringens. MEDICAL SCIENCES 2024; 34 (2) :121-128
URL: http://tmuj.iautmu.ac.ir/article-1-2160-fa.html

استادمحمدی سهیلا، نجومی سید علی، فاتح ابوالفضل، سیادت سید داور، ستوده نژاد نعمت اللهی فتاح. مقایسه دو روش استخراج وزیکول‌های خارج سلولی از Clostridium perfringens. فصلنامه علوم پزشکی دانشگاه آزاد اسلامی تهران. 1403; 34 (2) :121-128

URL: http://tmuj.iautmu.ac.ir/article-1-2160-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 34، شماره 2 - ( تابستان 1403 ) برگشت به فهرست نسخه ها
فصلنامه علوم پزشکی دانشگاه آزاد اسلامی واحد پزشکی تهران Medical Science Journal of Islamic Azad Univesity - Tehran Medical Branch
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 37 queries by YEKTAWEB 4657