سابقه و هدف: آرکیها میکروارگانیسمهای اکستروترموفیل هستند که سالها تصور بر آن بود که تنها میتوان آنها از محیطهای با شرایط دشوار از قبیل آتشفشانها ، اعماق اقیانوسهای و دریاچههای پرنمک به دست آورد. اما امروزه مشخص شده است که دستهای از این آرکیها ساکن دستگاه گوارش موجودات زنده از قبیل پستانداران، سخت پوستان و انسان هستند. از مهمترین سویه شناسایی شده آرکیها در دستگاه گوارش، می توان بهMethanobrevibacter smithii اشاره کرد. در این مطالعه، برای اولین بار آرکی متانوژن به صورت بومی جداسازی شد.
روش بررسی: در این مطالعه DNA آرکی از نمونه های مدفوع 20 فرد سالم با معیار های مورد نظراستخراج و سپس PCR آن در شرایط بهینه صورت گرفت، همچنین برای اطمینان از تکثیر ژن مورد نظر (rpoB) هضم آنزیمی توسط آنزیم محدودکننده انجام شد و در انتها نمونه ها در داخل E.coli(DH5α) کلون و تعیین توالی شدند.
یافته ها: از بین 20 نمونه مدفوع، در 18 نمونه جواب PCR (90%) مثبت گزارش شد. جوابهای مثبت به کمک آنزیم محدودالاثر AVAII تایید شدند و نتایج سکانس در سایت NBCI بررسی شد و مشخص شد نمونه جدا شده آرکی Methanobrevibacter smithii است.
نتیجهگیری: این مطالعه نشان میدهد با توجه به تنوع میکرورارگانیسمها در دستگاه گوارش، تعیین ژن اختصاصی و عدم داشتن همولوژی با سایر میکروارگانیسمها در جداسازی آرکی بسیار حایز اهمیت است.
واژگان کلیدی: متانوبروی باکتر اسمیتی، آرکی، مدفوع ، ژن rpoB. |
